パケット解析ソフトである Wireshark をインストールすると,同時に mergecap.exe というプログラムもインストールされます.
MS-DOS プロンプトより,以下のようなコマンドラインで複数のキャプチャーファイルを結合できます.
"C:\Program Files\Wireshark\mergecap.exe" -a *.pcap -w merged.pcap
注意点として,マージした結果,あまり大きなファイルにしてしまうとロードするだけでものすごい時間がかかりますので注意が必要です.
目安としては,pcapファイルサイズ * 4倍程度の物理メモリーが必要になる感じです.
PC に 8GB のメモリーが搭載されているのであれば,pcap ファイルは 1GB 以下に抑えるべきかと思います.